Skip to content

Podpis Genea w raku piersi

1 miesiąc ago

379 words

Liu i in. (18 stycznia) raport o sygnaturze genowej 186-genowej inwazyjności (IGS), która rozróżnia normalny nabłonek sutka od nowotworowych komórek raka sutka, które charakteryzują się ekspresją CD44 i niskimi lub niewykrywalnymi poziomami CD24. Podpis ten jest związany z przeżyciem wśród pacjentów z rakiem piersi. Profilowaliśmy 200 guzów piersi za pomocą mikromacierzy DNA i określiliśmy ich podtyp molekularny. Do klasyfikacji próbek podstawowych i dolnych wykorzystaliśmy IGS z 186 genów. Dwa podtypy były dobrze rozdzielone. Stwierdziliśmy, że 89% genów, które uległy nadmiernej ekspresji w komórkach macierzystych nowotworu, było koordynacyjnie nadeksprymowanych w podstawowych próbkach. To powiązanie zapewnia powiązanie między swoistą cechą raków piersi (podstawowy podtyp) a komórkami macierzystymi raka, wzmacniając znaczenie IGS z 186 genów. Wynik sugeruje, że podstawowe nowotwory piersi są wzbogacone w rakotwórcze komórki macierzyste raka sutka lub utrzymują podobny profil transkrypcji dzięki blokowi różnicowania, co częściowo wyjaśnia złe rokowanie dla pacjentów z takimi nowotworami.
Dr Francois Bertucci, Ph.D.
Nathalie Cervera
Daniel Birnbaum, MD, Ph.D.
Institut Paoli-Calmettes, 13009 Marsylia, Francja
[email protected] fnclcc.fr
Odniesienie1. Liu R, Wang X, Chen GY, i in. Rola prognostyczna sygnatury genów z nowotworowych komórek nowotworowych piersi. N Engl J Med 2007; 356: 217-226
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
Rysunek 1. Ryc. 1. Korelacja między sygnaturą genów inwazyjności (IGS) a sygnaturą o wykryciu genetycznym. Dla każdego z 402 pacjentów wynik klasyfikacji dla oceny genetycznej obliczono jako sumę wartości ekspresji, ważonych lub -1 według sygnatury i określono korelację między wynikiem oceny genetycznej a IGS. Linie przerywane wskazują średnie wartości dwóch zmiennych.
Liu i in. konkludują, że opracowany przez nich 186-genowy IGS jest nowy, ponieważ wykazuje niewielkie nakładanie się z innymi sygnaturami raka piersi. Jednak IGS, który omawiają, jest podobny do sygnatury genetycznej zdefiniowanej i scharakteryzowanej przez Ivshina i in. w zestawie danych od ponad 400 pacjentów.1 Obie sygnatury wydają się mieć znaczenie rokownicze w przypadku nowotworów wyłącznie o stopniu pośrednim. Aby rozwiązać ten problem, przetestowaliśmy niezależność IGS i genów 264 zidentyfikowanych przez Ivshinę i wsp., Dodatkowo zmotywowanych przez niedawny artykuł sugerujący zależność między kilkoma podpisami raka piersi pomimo niewielkiego nakładania się. Na podstawie naszych danych IGS i 264 klasyfikatory genetyczne miały korelację na poziomie 0,81 (P <0,001) i zgadzały się co do klasyfikacji 85% guzów (ryc. 1). Ponieważ podpis 264-genu jest w dużej mierze markerem proliferacji, wykluczenie zależności od proliferacji wydaje się teraz ważne w demonstrowaniu nowości IGS.
Kristian Wennmalm, MD
Karolinska Institutet, S-171 76 Sztokholm, Szwecja
[email protected] se
Lance D. Miller, Ph.D.
Genome Institute of Singapore, Singapur 13872, Singapur
Dr Jonas Bergh, Ph.D.
Karolinska Institutet, S-171 76 Sztokholm, Szwecja
2 Referencje1 Ivshina AV, George J, Senko O, i in. Genetyczne przeklasyfikowanie stopnia histologicznego wyznacza nowe kliniczne podtypy raka piersi. Cancer Res 2006; 66: 10292-10301
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Wentylator C, Oh DS, Wessels L. i in. Współzależność między predyktorami opartymi na ekspresji genów w raku piersi. N Engl J Med 2006; 355: 560-569
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
Liu i in. donoszą, że stan receptora estrogenowego i różnicowanie guzów przewyższają wartość prognostyczną IGS wśród pacjentów w ich badaniu. Sugerujemy, że ich dane mogą być ograniczone zarówno przez niedostatek próbek, z których pochodzi ta sygnatura, jak i heterogeniczne cechy histologiczne, pochodzenie guza i leczenie. Aktualne wyniki powinny zostać zatwierdzone przed włączeniem tego podpisu do badań klinicznych.
Wendy A. Woodward, MD, Ph.D.
Anthony Lucci, MD
Massimo Cristofanilli, MD
University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX 77030
[email protected] orgfor Advanced Research Center for Micrometastatic Disease

Odpowiedź
Autorzy odpowiadają: Zgadzamy się z Bertucci i współpracownikami, że rak podstawnokomórkowy prawdopodobnie reprezentuje podgrupę raka sutka, w którym komórki rakowe są blokowane we wczesnym stadium różnicowania.
Zgadzamy się z Woodwardem i współpracownikami, że receptor estrogenu jest ważnym czynnikiem prognostycznym. Niemniej jednak, jak pokazano w Tabeli 3 naszego artykułu, IGS wiąże się z rokowaniem u pacjentów pozytywnych względem receptora estrogenu. Rak piersi piersiowych jest generalnie ujemny pod względem receptora estrogenowego, więc takie nowotwory zostały usunięte z naszej analizy. Dlatego też siła prognostyczna IGS nie opiera się po prostu na identyfikacji raka piersi z ujemnym receptorem lub rakiem podstawnokomórkowym. Zgadzamy się również, że IGS opierało się na izolacji komórek macierzystych raka piersi z zaledwie kilku próbek i że analiza znacznie większej grupy pacjentów mogłaby skutkować poprawą sygnatury. Niemniej jednak fakt, że sygnatura pochodząca od zaledwie kilku komórek macierzystych raka sutka ma znaczenie prognostyczne, przemawia na korzyść badania tej populacji komórek nowotworowych.
Dr Wennmalm i jego koledzy pytają, czy IGS ma znaczenie prognostyczne, jeśli zostaną usunięte geny proliferacji. Aby sprawdzić, jak ważne są geny związane z proliferacją w odniesieniu do sygnatury genu, usunęliśmy wszystkie 15 genów zaangażowanych w proliferację komórek lub cykl komórkowy z IGS i wykorzystaliśmy pozostałe geny jako sygnaturę do przewidywania wyników pacjentów w Holenderskim Instytucie Raka Baza danych. Pozostała sygnatura genu nadal była istotnie związana ze śmiercią (P <0,001, współczynnik ryzyka, 1,34) i przerzutami (P <0,001, hazard współczynnik, 1,29).
Michael F. Clarke, MD
Stanford University, Stanford, CA 94305
Rui Liu, Ph.D.
University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109
Xinhao Wang, Ph.D.
Oncomed Pharmaceuticals, Mountain View, CA 94043
(11)
[więcej w: zabiegi fizykalne, badanie ige całkowite cena, komórki macierzyste kraków ]